主要有以下几个方面：①酶制剂对畜禽生理、微生态和内分泌的影响；②预测底物浓度的方法，以便利用模型来预测酶制剂的反应以及最经济和有效的用量；③木寡糖、植酸酶、菊粉内切酶、角蛋白酶等基因工程菌高效表达、分离技术和高效利用技术和酶的廉价生产技术；④酶的性质改良，包括酶的pH性质、温度性质、抗蛋白酶能力等；⑤饲用酶制剂与动物日粮中的营养当量关系；⑥将植酸酶基因转移到饲料作物中，如玉米等，使饲料作物本身就含有植酸酶基因。
2酶制剂未来的研究方向
(1)酶的效应模型：酶制剂的用量主要是根据畜禽特异性和底物特异性来确定；但是，目前还没有建立起能简单地预测酶对动物生产性能反应的合适的模型。将酶、底物、动物三者联系起来，建立三者之间的动态模型是确定酶适宜添加量的关键和根本途径。
(2)酶的营养价值：截止目前，植酸酶的潜在营养价值有相对完整的数据；但是其他酶制剂的潜在营养价值并不完善或者根本就没有。酶制剂的潜在营养价值和酶的效应模型在某些方面有共同之处，但潜在营养价值相对要简单一些，容易突破。能在酶的标准化基础上进行潜在营养价值研究将更有意义，也可以减少工作量。
(3)酶的稳定化技术：影响酶制剂稳定性的因素很多，除热稳定性外，还包括对动物消化道或饲料中pH的稳定性、对重金属的稳定性、对蛋白酶的耐受性、酶的贮存稳定性、对饲料中抑制剂的稳定性等。
酶的稳定性是酶的供应商和使用者最普遍关注的问题之一，为此也进行了相对较多的研究。通过酶制剂的后处理技术，如包埋、制粒、载体吸附及部分化学处理技术，虽对提高酶的稳定性有一定作用，但作用很有限，而且不能全面提高上述的各项稳定性。通过微生物筛选和基因工程技术也许是提高酶制剂稳定性一劳永逸的途径。
(4)酶活分析方法：至少应包含两个方面的研究内容：①建立一种统一的酶活检测方法及酶活表示方法，便于酶的产品质量控制及同类产品相对意义上的比较。由于不同微生物所产的酶在性质上存在着一定的差异，建立绝对统一的检测标准有一定的难度，但应以主流酶制剂检测方法为标准或者在标准中建立副检测方法。②酶活的检测条件应模拟动物的消化道环境，而不应以该酶的最适作用条件作为检测条件(汪儆等，2000a，2000b；Thacker等，l996)。有关影响酶活的动物消化道环境也是重要的研究内容。
(5)酶制剂的生物学评定方法：正如前面所讲的，酶制剂没有统一的生物学评定方法。酶制剂是否有效果?仍然是不少使用者所疑惑的，此疑惑关键原因在于缺乏可靠的动物试验结果。酶发挥作用有其特殊性，需要更精确的试验条件，不同畜禽需要至少的试验头数?试验期?考察的指标等?需要建立统一的标准。
(6)最佳性价比的酶制剂使用量：酶制剂的添加量和所产生的效应并非完全的正相关线性关系，饲料添加剂研究与应用进展：2008年版而是呈一条抛物线的关系。一定添加量以下，添加效应对添加量有强依赖性，而在此添加量以上，随着添加量的增加，添加效应增加幅度明显降低，有时需要增加数十倍的添加量才能使添加效应提高一倍。所以，探求最佳性价比的酶制剂使用量是一项重要研究工作。但此最佳性价比随动物种类、饲粮组成、饲料和酶制剂的成本变化而成比例变化，酶制剂的最佳经济剂量也会变化。
