工业微生物菌种资源是指在食品工业、发酵工业、轻化工、生物转化以及石油、冶金、环保等工业领域具有应用价值和一定科学意义的微生物菌种及其相关信息资料。主要包括细菌和真菌，按功能可分为生产用菌种、过程控制用菌种、分析及检验用菌种等。工业微生物菌种资源是生物产业持续发展的关键，收集和保藏工业微生物菌种对保持工业生产的持续进步具有重要意义。
国家工业微生物菌种资源平台 (NIICR)是国家科技基础条件平台和国家自然科技资源平台的重要组成部分，由国家规划投资建设并维持运转，具有社会基础性和公益性。NIICR建设项目于2003年启动，已累计投入专项经费418万元。
NIICR以工业微生物菌种资源的实物、数据和网络为三要素。通过建立合理有效的共享机制，在国家配套政策法规的保障下，采用统一的资源描述规范和标准化的整理技术规程，实现跨地区、跨部门、跨领域整合现有存量资源，收集优化增量资源，改变我国工业微生物菌种资源保藏管理现状，实现国家工业微生物菌种实物与信息资源的社会共享，为工业微生物产业领域的科技创新和生产开发提供菌种资源服务。
NIICR依托于中国食品发酵工业研究院CICC及其现有全国性资源网络，以自愿加入为原则，吸纳具备资质条件的工业微生物资源单位，组成工业微生物菌种资源网络会员体系，成为国家微生物资源平台的重要组成部分；会员应承诺遵守章程，尽会员相应义务；经标准化整理、整和建立起的工业微生物资源实物库和数据库，按国家自然科技资源平台统一的管理模式及共享方案运行，并经自然科技资源平台进入国家科技基础条件平台，实现资源的社会共享。
NIICR还将涉及我国工业微生物菌种资源相关管理制度、相关技术标准和规范的拟定、建议、实施与普及。NIICR建设完成后，将在工业微生物菌种资源保藏管理、工业微生物菌种资源鉴定和评价、工业微生物菌种资源实物和信息共享以及专业人才培养等四大方面，形成资源丰富、结构完整、功能齐全、技术先进并与国际接轨的工业微生物菌种资源共享平台。
目前参加NIICR的有天津市工业微生物研究所、上海市工业微生物研究所、四川省食品发酵工业研究设计院、湖南轻工研究院、黑龙江省轻工科学研究院以及北京工商大学和东北农业大学等单位。
