国家食品质量监督检验中心挂靠在中国食品发酵工业研究院，是在原轻工业部食品工业产品质量检测中心的基础上不断完善后发展起来的。早在20世纪70年代初，为适应国家食品出口的需要，国家食品质量监督检验中心的前身轻工业部食品发酵工业研究所的检测部门就开始承担进出口产品发生质量争议的仲裁检验，采用国际上公认的现代分析技术，先后为国家驳回了数起索赔案，维护了我国的声誉。为此轻工部于1980年12月7日批准在原轻工部食品发酵工业科学研究所内建立轻工业部食品质量监督检测中心，下设十一个分站，分布在全国各地。1985年原国家标准局质量监督司将我中心作为第一批筹建的国家级产品质量检验中心之一。1989年4月1日经原国家技术监督局审查认可，同年4月4日发文公布为国家级食品质量监督检验机构。1994年4月本中心经方圆委认证，获得"实验室认可证书"，1994年5月通过原国家技术监督局复查，1997年9月通过原国家技术监督局监督检查，1999年1月经中国实验室国家认可委员会评审认可为认证实验室，2000年11月通过认可委第一次监督评审，2002年4月通过认可委第二次监督评审，2004年3月通过中国实验室国家认可委员会评审认可为认证实验室复评审。
2004年7月，为完善国家产品质量安全检验检测技术体系，保护青少年一代的身心健康，中心与宋庆龄基金会、共青团中央中国少先队事业发展中心合作筹建 "国家青少年食品质量监督检验中心"，国家认监委和国家质检总局于2004年10月11日向筹建"青少年食品质检中心"的主管单位宋庆龄基金会下发了《关于同意筹建国家青少年食品质量监督检验中心的复函》（国认实函[2004]234号），经过筹备，实验室在组织机构、人员素质、仪器设备、工作场地、环境条件、管理制度等方面达到了国家产品质量监督检验中心基本条件的要求， 2005年5月国家青少年食品质量监督检验中心正式被国家质检总局批准成立。
中心现有人员19名,其中工程师以上职称13人，占68.4%（包括教授级高级工程师1人，高级工程师11人）；助工5人，占26.3%；技术员1人，占5.3%。下设办公室、业务室、内部审核小组和五个检验室，共有建筑面积1300多平方米，设有气相色谱仪、液相色谱仪、原子吸收及荧光光谱仪、紫外光谱仪、旋光仪、纤维素分析仪、质谱仪等十余台大型精密仪器室，还有微生物测定室、天平计量室、样品室、样品消化处理室等硬件设施。
业务范围：
1、承担国家指定的食品及发酵产品的质量监督检验、仲裁检验、委托检验及市场准入产品检验。
2、对实行生产许可证产品的质量、重要新产品投产的鉴定、产品质量的认证进行检验和复检。
3、承担食品科研成果鉴定检验。
4、负责食品方圆认证产品质量检验。
5、研究开发新的检验技术和方法，对企业的质量检验机构进行指导和人员培训。
6、参与国家标准、专业标准制修订和检验方法确认工作。
授权检测产品:
食品产品
? 罐头类：肉类、果蔬、水产、坚果等
饮料类：碳酸饮料、运动饮料、乳酸菌饮料、饮用天然矿泉水、饮用纯净水、茶饮料、果汁及果汁饮料、固体饮料、植物蛋白饮料等
? 冷饮类：冰淇淋、雪泥、雪糕、冰棍等
? 糖果类：硬质糖果、夹心糖果、巧克力等
? 焙烤食品类：饼干、月饼、面包、糕点等
? 方便食品、休闲食品类：方便面、果冻、蜜饯、花生制品、烤鱼片、膨化食品、小食品
炒制品等
? 儿童食品类：婴幼儿食品、婴幼儿辅助食品、婴幼儿强化食品
? 食品添加剂类：保鲜、防腐、抗氧化、营养剂等
? 保健食品类：鱼油、海藻类等不饱和脂肪酸测定等
发酵产品
? 啤酒类：淡色啤酒、浓色啤酒、熟啤酒、生啤酒、特色啤酒等
? 白酒类：酱香、浓香、清香、米香、凤香、液态等
? 黄酒：干黄酒、半干黄酒、半甜黄酒、甜黄酒
? 葡萄酒：干葡萄酒、半干葡萄酒、半甜葡萄酒、甜葡萄酒等
? 进口蒸馏酒：白兰地、威士忌、俄得克等
? 国内知名白酒的真伪鉴别：贵州茅台酒、五粮液、酒鬼酒等
? 进口蒸馏酒的真伪鉴别：轩尼诗、人头马、马爹利等系列产品
食用酒精
味精
? 酱油
? 豆制品
